С чего это вы взяли?
На каком басу наблюдали такой эффект?
О каких звуковых картах идет речь?
На любом пасивном басу/гитаре будет этот эффект. "Минусы такого подключения – размазанный звук, ощутимое количество шумов. Происходит это из-за того, что выходное сопротивление гитары не согласовано с таким входом." - Это вам любой поиск по интернету скажет и все, кто в теме - тоже. У активной электроники выходное сопротивлениe намного меньше, потому и будет "совмещено" с line-in.
Про смешивание сигналов с датчиков: когда громкость двух снимателей выкручена "до конца" происходит взаимоисключение сигналов, совпадающих по фазе, потому гитара начинает звучать тише и звук становится глуше, как бы придушеный. Потому я и прошу проверить, как звучат датчики по отдельности. EMG для этого и делает свой ABC - он выполняет функцию микшера и разъединяет сниматели электрически, т.е. они не грузят друг друга, и их сигналы не взаимопогашаются.
Для проверки "кишок" на болезни, можно подключать сниматели напрямую к гнезду, но только по-одному. Неплохо-бы проверить сопротивление потенциометров, мало-ли...
Кабель, тоже должно проверить, если из комплекта - то в печку его. Брать качественный (проверенный).