Нет, одновременно, не будет, если у вас не Макинтош.
Можно (и нужно, когда две карточки или более) одну настроить чисто для Винды, то есть системных звуков, а другую для работы с DAW или музыкальным софтом, но одновременно может работать только один ASIO драйвер.
Да и зачем делать ввод через одну карту, а вывод через другую?
Хотя, если подключать колонки, то в тако случае может потребоваться аналоговый микшер, куда подключатся две карты, а если только наушники, то придётся перетыкать.