имхо, когда звук струны отличается от звука на лад выше/ниже - звук идет не ровно, а плавает как с тремоло - уауауауауауа - громче-тише... возможно это из-за сучка в деревяшке или еще каких то косяков дерева, склейки/сборки грифа. Резонанс на этом месте грифа "ломается", не звучит нормально нота.
Я такую хрень наблюдал только на одной своей гитаре - скваере за 140$. Жить с ней можно, но на кастомшопе за 2500 меня бы это напрягало реально...
многие похожие косяки кстати лечатся сменой струн. Иногда бывает что не звучит струна, не строит, звенит... после смены все ок.