Обычно первая (самая тонкая) - 1.5 мм, а шестая (самая толстая) - 2 мм от лада, думаю, это допустимый минимум высоты, далее повышаешь по вкусу. От высоты зависит сила нажатия и немного звучание. Мне нравится на минимальной упомянутой, но у меня тонкие в Е Standard (стандартный Ми строй), а не такие, как у Вас (какие-то толстые), звучание мне нравится, но при понижении появляется бряск, дребезжание, его количество уже очень тонко зависит от качества гитары, я думаю, это тот момент, где цена гитары проявляет себя, чтобы на 1.5-2 мм высоте было этого мусорного дребезжания по минимуму, но это допустимо в небольшом количестве на такой высоте, так как в запись это не попадает, особенно на перегрузе ))) В общем, выше - лучше для чистоты звука, но хуже для пальцев и качества быстрой игры. Подбираеться индивидуально по слуху и удобству пальцев. Про зависимость высоты от толщины струн не слышал, какая бы она толстая не была, всё равно висит на той же высоте от лада, на какую выставите, мерять нужно точной линейкой от лада до начала Вашей супер-толстой струны (верхнюю часть струны не мерять, а только пространство от лада до нижней поверхности струны/начала струны).
Если вопрос о том, как природнять - на ютуб есть множество видео, у бриджа (где обычно правая рука бывает ложится) два болта перпендикулярно гитаре, один внизу бриджа, другой вверху, плоской отверткой крутится, можно салфетку подложить, или очень тонкую тряпочку, что б не содрать краску (если болты красиво крашены) и так через тряпочку аккуратно проворачивать на нужную высоту низ и верх бриджа (низ, это первая струна). Но может понадобиться и настройка рабочей длинны каждой струны, а то может строить не правильно, то есть при изменении высоты этот параметр может "сбиться", это 6 болтиков паралельных поверхности гитары. Лучше смотреть видео, есть много доходчивых на ютубе.