Если это первая настройка, то на гитаре скорее всего стоят заводские струну. Настраивать следуют уже с новым комплектом, иначе придется все делать заново.
Для начала настрой гитару в тот строй, в котором будешь играть. Это важно, иначе нормально не настроишь.
Настрой анкер. Зажимаешь струну на первом и последнем ладу. Расстояние от струны до 6-го лада должно быть 0,2-0,3 мм. Резко крутить гайку анкера не стоит. Поворачивай не больше чем на четверть оборота в час, а лучше вообще аккуратно повернуть и оставить на ночь. В зависимости от дерева и струн дерево может придти в окончательную форму за довольно длительное время.
Когда добьешся нужной кривизны, настраивай высоту струн. Опускай максимально низко, пока не будет ладить. Несильный звон не страшен - после усиления его не будет слышно.
И потом уже займись мензурой. Ее настройка зависит от бриджа гитары.
При смене калибра или производителя(иногда) струн или строя все надо будет сделать заново.