Если проблема одинакова на разных гитарах, значит она кроется в том, что у этих гитарах одинаково. Чисто из теории. Настройка высоты струн или ваша манера звукоизвлечения. Попробуйте проверить - поднимите/опустите струну или попросите знакомого гитариста сыграть на этой гитаре тот же тест.
А из моей невеликой практики (так себе я гитарист, самокритично), ну и на мой личный вкус, конечно, третья неоплетенная струна звучит всегда отвратно. Поэтому я всегда покупаю комплекты с третьей оплетенной. У таких комплектов на пачке, где перечень калибров, около третьей струны приписана буква w - wound.