Думаю их чем то залить, эпоксидкой или чем то аналогичным затем зашлифовать. Что нибудь придумаю... ))) 
чисто эпоксидкой наверное не стоит, будет бросаться в глаза. Попробуй пыль от венге смешать с ней или с клеем и на куске дырявом залить, если остался
Местные мастера, когда инкрустацию вклеивают в гриф, в клей чето подмешивают, если не ошибаюсь,
чтобы сильнее торкало чтобы цвет клея был идентичен темной деревяшке на всяких углах и краях хитрых узоров. Обратись к ним.
... и добавил:Влад Теремшонок, будет бросаться, если пятно шмякнуть. тут же мелкая работа, можно и замаскировать.
или вообще стандартный лп пикгард туда повесить, кстати, он их все закроет, возможно. но это "костыль", не очень честный.