Привести в порядок лады, если с ними что-то не так, всегда полезно. Я только не понимаю, как они могут влиять на звук открытых струн.
По поводу сэмпла: первая струна - отлично, вторая - на четыре балла, третья - на троечку, остальные примерно как 2-я. Мой вариант - резонирует анкер. Попытка его задемпфировать мне не кажется сильно бредовой идеей
Однако, большого криминала я не вижу. Третья струна без оплетки всегда самая проблемная, можно попробовать комплект струн, где 3-я в оплетке. Правда при этом бенды делать на ней будет труднее.
В какой-то мере проблему можно смягчить звукоизвлечением. Если хочешь певучего звука, то играй медиатором ближе к грифу. Удар медиатора по струне нужно при этом делать мягко, но быстро, как бы "вытаскивая звук" из инструмента, заставляя его "выплывать из глубины корпуса". При этом полезно чуть-чуть уменьшить громкость на инструменте - это слегка срежет проблемную верхнюю середину. Если делать на длинных нотах пальцевое вибрато и использовать бенды, то так можно "сбить" начало биений. Для коротких нот применяй глушение правой рукой - ноты будут "отскакивать от струн" и никаких биений не будет.
Полезно дать поиграть свой инструмент кокому-нибудь более опытному в гитаризме товарищу и послушать со стороны, как твоя гитара звучит у другого человека.
Кстати говоря, хорошие инструменты с "поющим деревом" гораздо более требовательны к звукоизвлечению, так как на них сразу вылезают все, даже минимальные, огрехи. Не знаю, примешь ли ты мой совет, или нет, но я его дам. Гитару ты уже у мастера проверял на предмет явных дефектов. Таковых, как я понял, не нашлось. Датчики запарафинил. Лады, конечно, можно закатать, анкер попробовать задемпфировать. Я правда не знаю как: лить в отверстие льняное масло, оно же "олифа натуральная" - возможно, выход. Сам бы я так и сделал на своем инструменте, но другому не буду советовать - вдруг накладка отклеится, или анкер этой застывшей олифой потом заклинит и он перестанет работать. Итак совет: может просто сделать перерыв в гитарных занятиях на денек - другой, а после этого начать заниматься музыкой. А все проблемы со звуком пока принимать на свой счет, а не на счет инструмента. Представляешь, как ты вырастешь как музыкант при таком подходе? Удачи.