Я не электронщик, и даже если дать мне схему я не смогу ответить на вопрос есть ли там аналоговая секция.
Но мне достаточно воображения для того, чтобы представить, что на нескольких микросхемах можно реализовать пару-тройку базовых типов перегрузов, и при помощи цифрового управления как-то сделать из этого всего 12 алгоритмов (тем более что это boss - фирма, которая специализируется на разнообразных перегрузах).
Да и почему вообще вас удивляет то, что в процессоре есть аналоговая секция? В ту пору (когда вышел гт-3) это было очень модно, и дигитеки и роктроны тоже использовали подобный подход.
На 100% утверждать не стану, но инфа с официального сайта касаемо gt-3: "Includes 12 analog distortion and overdrive effects"