при перепрошивке прэссеты вобьются заводские/прошивочные. Т.е. чтобы сохранить свои, да, сохраняй на комп. Потом после перепрошивки вольешь обратно. Не забывай, что с новыми версиями параметры усилков и эффектов могут меняться, а значит, чтобы получить "свое" звучание таки придется после заливки прэссетов каждый из них покрутить, чтобы снова четко вернуть "свой" звук.