Ocelot, Здравствуйте!
Все правильно, в контроллере можно запрограммировать 2 миди канала для отправки двух разных сообщений Program Change (по одному на канал). В Вашем случае просто надо либо на две группы разбить приборы и использовать для каждой свой канал, либо вобще один миди-канал использовать для всех приборов, а уже под номер PC, посылаемый с контроллера, настраивать индивидуально каждый прибор, что вполне возможно сделать, судя по девайсам.