Да 12 лад это на октаву выше...
Есть 2 возможные проблемы:
1. Не отстроена мензура. Выход: отстроить мензуру
Фланжелет на 12 ладу должен звучать как зажатая на 12 ладу... Или так: зажатая на 12 ладу должна = зажатая на 13, но при этом медатором надо дергать со стороны головы грифа...
2. Бывает такое, что кроме основного звука (ноты) струна доет еще какой-то, причем он может быть достаточно громкий. Когда эти два звука накладываются, то слышна как бы другая нота.
Я с таким сталкивался на нескольких гитарках. Например бывает настрошь что 6 стр. зажатая на 5 звучт, как открытая 5 стр. А аккорды все равно фальшивят и 6 стр. зажатая на 7 не звучит как 5стр. зажатая на 2. Короче этот призвук слух обманывает. Выход: настраивать аккордами...
Тюнер ИМХО не самый точный настройщик, если учесть ,что в звучании гитары куча гармоник...