NNOVER, под независимостью оцифрованного сигнала обычно имеется ввиду именно тот случай, когда сигнал передается ввиде двоичных данных (фактически, между АЦП и ЦАП). а в твоем случае уместнее сказать "обработанный цифрой аналоговый сигнал". отсюда вывод, что компенсировать не получится.
на слух паразитная емкость не скажется в том случае, если цифровая обработка поганит звук сильнее, чем сам кабель.
выход простой -- качественный кабель, либо активка.