1. Контакт ощущается, меня с непривычки (когда меняешь гитару с "чистым" грифом на "инкрустированный"), даже отвлекает... потом привыкаешь и перестаешь замечать. Хотя сам "контакт" пальцев с поверхностью накладки достаточно редок... Зачем пальцем по грифу елозить?
2. На звук конечно влияет (простая физика), но степень этого влияния на общее звучание инструмента считаю столь незначительной, что нет никакого смысла рассуждать о ней

3. Можно поступить как SD, когда разрабатывали датчики, заказать две идентичные гитары из одних и тех же досок... в нашем случае, одну с инкрустацией, другую без и попробовать... ИМО единственный способ, разобраться.