получается только одно деревяха мешает 
В каком-то смысле так и есть, колебаниям струны она мешает, ибо отражает не всю энергию, часть абсорбирует. Кроме того, материал сам по себе неоднородный, не очень прочный, если бы кто-то смог найти ему адекватную замену, было бы круто. Но насколько это возможно в принципе - хз.
Часть причин, по которым дерево на звук влияет, очевидны, а некоторые вещи мне не очень понятны. Например, понятно, как та часть гитары, которая между бриджем и порожком находится, влияет на колебания. Понятно в принципе, что в том месте, где, допустим, бридж крепится к деке, часть энергии колебаний струны отражается обратно в фазе, часть не в фазе, часть переходит тупо в тепло и теряется, а часть идет в саму деку. Ну и это, допустим, тоже важно. Хотя насколько - уже вопрос. А вот, например, форма и материал ушей у гитары со сквозным грифом за счет чего влияет на звук? Тоже в принципе объяснений много можно найти, но какой вклад у каждого из этих факторов - мне лично интересно было бы узнать, и это уже далеко не очевидные вещи.
Только это все, кмк, не исследовал никто всерьез. Нобелевскую премию за это не получишь, а производителям гитар это точно не надо. Вот и получается, что вся аргументация на уровне дурацких мультиков и экспериментов из ютюба, рассказов про "а у меня была гитара Х, она звучала так-то", ну и всяких религиозных верований.