Слишком много вариантов, из-за чего это могло произойти. Я бы, для начала, локализовал проблему. То есть нужно последовательно заменять или исключать элементы тракта, то есть попробовать с другой гитарой, попробовать с другим преампом (или без преампа) и т. д. Гитара на чистом нормально звучит?