Хух, блин, разобрался, наконец-то.. Чтоб им там икалось, разработчикам... В кубе есть такая зараза, как "Упреждающая запись", в меню "Файл", пункт "Параметры", раздел "Запись", подраздел "Аудио"... У меня была выставлена 1 секунда.. Вот оно к каждому файлу перед записью, писало ещё секунду тишины... В итоге, если этот файл потом в дальнейшем куда-то импортировать, то его начало длиннее на величину этой тишины.. Поставил ноль - всё стало ок.. Ну, т.е., как ок - все что ранее записывалось уже кривое, а то что буду записывать в дальнейшем, будет уже нормально..
Блин, а я уже нуэнду поставил, думал косить нафик этот куб.. Потом открыл сей проект в нуэндо, попытался импортировать файл - то же самое.. Тут-то меня и осенило, что значит, куб начудил при записи.. Ну, соответственно и полез искать в параметрах записи решение проблемы.. Как хорошо, что так всё решилось...