Maddreg, «а-» и «нон-» это абсолютно одно и то же, просто первое взято из греческого языка, второе — из латыни. Загвоздка в том, что люди очень часто путают «а-» и «анти-» — вот это уже, таки да, не одно и то же. Из-за этого, в общем-то, и пришлось ввести понятие «нонтеизм» — чтоб народ не путался.
Также есть мнение, что «атеизм» это общее понятие, а «нонтеизм» и «антитеизм» — понятия менее общие, частные.