Я не сталкивался с этим.
Просто я всегда клацаю на последнюю страницу непрочитанной темы, или нажимаю кнопку "все" (страницы на одной), если их до 100?
для меня
"Новые ответы на ваши сообщения" - кнопка номер один. я бы вообще ее сделал
большой и красной 
. в новом движке ее почему-то уменьшили до комариных размеров.

способ хождения по форуму у меня следующий:
1. жмакаю
"Новые ответы на ваши сообщения".
2. если в списке есть хотя бы одна тема, выбираю тему по-настроению и жму кнопочку
"new". иначе - выхожу из цикла.
3. попадаю на самое первое сообщение в выбранной теме, которое я еще не читал.
4. читаю, отвечаю, комментирую, плюсую/минусую.
5. перехожу к пункту 1.
проблема в том, что раньше кнопка "new" переносила меня на первое непрочитанное сообщение и попутно сбрасывала флажок темы как "имеющую новые сообщения". т.е. я мог нажать на "new" и тут же нажать "Новые ответы на ваши сообщения", обнулив таким образом флажок "тем с новыми сообщениями" (способ борьбы с темами, которые мне уже неинтересны). флажок при этом обнулялся вне зависимости от того, где находилось первое новое сообщение.
теперь же происходит следующая петрушка: жму "new" и попадаю на первое непрочитанное сообщение, которое, допустим, находится не на последней странице. если я сейчас жмакну "Новые ответы на ваши сообщения", эта тема все-равно останется в списке непрочитанных! просто указатель на первое непрочитанное сообщение переместится на первое сообщение следующей страницы. что есть очень неудобно.
блин.. опять путанно объяснил..
... и добавил:
... и добавил:
Причем в настройках лички стоит галочка на "Всплывающее окно при появлении нового сообщения", но по факту не фурычит... 
я всегда всплывающие окна блокирую во всех браузерах. поэтому эта фигня меня не парит.
