kinoman,
с установочного диска запускаешься, доходишь до консоли восстановления, там делаешь chkdsk c: /r
ждёшь конца, перегружаешь
с установочного диска делаешь установку, когда установщик найдёт уже поставленную винду - выбери "восстановить". Он переустановит систему поверх, сохранив реестр, работоспособность программ и юзеров с профилями.