Haterbreed,
Подключи встроенную в юльке по цифре (если коаксиальный цифровой выход на матери есть) и пользуй для скайпа встроенную, вывод будет через юльку, я сам так и делаю. На худой конец можно ведь устройством записи в скайпе указать встроенную, а юльку как устройство воспроизведения.