есть специальные инструменты, некоторые прописаны прямо в программах, типа Declick или EnvelopeShaper, и есть отдельные, типа RX De Noise, Waves Trans-X
есть устройства типа SPL Transient Designer
ну или как-то вручную выделять транзиенты, которые тебе не нужны, и назначать им лимит на атаке