Вообще-то по индикаторам карты смотреть не всегда стоит, лучше смотреть по индикации хоста (в кубе по индикации входной шине, крайней слева в микшере). Но, касательно C400, на ней надо не забыть включить Pad на инструментальном входе, тогда должно хватить на любой актив, в-принципе даже на 18 В. Ну и не стоит забывать что у актива на 9 В бывает внутренний клиппинг, клиппит пред самого датчика, даже на 18 В такое иногда можно узреть (зависит от расстояния датчика до струн). А так активу на 9 В вполне хватает уровня входа +12 dbV (около 4 В), у C400 с падом вообще +16 dbV (6.3 В).
Что касается роутинга, делается моно-дорожка в кубе, она панорамируется по центру. Всё, гитара звучит по центру, ничего сложного. Если пишется стерео-дорожка, то, ясен пень, сигнал пишется там где он есть - т.е. в одном из каналов и звучит там же. Надо писать моно-дорожку для каждой партии, тогда панорамируется как надо, моно-файл в любом плеере нормальном будет воспроизводится посерёдке тоже.