Из того что пользуюсь - нуендо3, но кое-что удобней делать в Tracktion... сводить например, но начальную работу делать неудобно. В нуендо3 я ненавижу "фиксированный" роутинг, когда нельзя перенаправлять сигнал из групповой дорожки в другую, если она имеет ниже номер. То что плагины нельзя таскать как вздумается.
Проблемы со звуком могут быть из-за того что:
1) Битность проекта 16, и частота не та. Надо как минимум 24 бита.
(32 бита уже лишнее, для входных данных).
VST-архитектура это работа в 32х битах, на вход поступает 24 (для профи-карт), в стендалоне всё работает на максимуме возможного, в хосте при простом мониторинге битность не влияет, но запись ведётся с битностью проекта.
2) Стендалон имеет стерео-выход, тоже может быть причиной.
3) Уровень на входе ниже, например из-за неправильного роутинга.