По постам не совсем если честно понимаю, что ты там делаешь.
Но при той цепочке, которую я написал пишется чистый звук гитары, но в реальном времени обрабатываемый амблитьюбом.
Хочешь получить обработанную дорожку - записывай и потом делай её миксдаун (file > export > mixdown)
После - импортируешь в проект обратно уже обработанную эффектами дорожку.
Гитару куда втыкаешь? в инструментальный вход? (на передней панели который).
Проверь, что на в меню "Input" дорожки он выбран (там всего из 2-ух выбор)
Сигнал вообще поступает в программу? (по индикаторам видно будет)