чтобы выделить флажолет, поставь перед ампсимом и грелкой эквалайзер и найди какую частоту нужно выделить чтобы он зазвучал. В кубе так же удобно получается вырезать кусочек где флажолет и сделать его погромче - это пара кликов мышкой.
Для редактирования аудио можно попробовать скачать последний melodyne, волшебная штука, там есть полифонический режим, он отражает сыгранную партию как нотную запись в кей эдиторе секвенсора, и можно по своему усмотрению удалить какой нибудь лишний шум-призвук, ноту или изменить высоту одной только ноты в аккорде (бывает запишешь гитару со сбитой мензурой). Там есть ещё и автоквантизация аудио, правда я её не тестировал.