flatlander, Дак в чём проблема? Сам не пробовал, но теоретически должно работать:
у звуковухи линейный стереовход. Стереовход, это два моно канала. Паяем шнур или переходник с помощью которого на левый канал подаём одну гитару, на другой другую. Потом берем кубэйс или нуэндо в качестве хоста, создаём два моно трека. На первый трэк посылаем сигнал с одного канала, второй трэк с другово. Вешаем на каждый из них те эффекты которые нам нужны. Нажимаем кнопочку на трэке, на которой нарисован динамик. Всё должно работать. Может такую же вещь можно проделать с какими нибудь хостами.