Voxengo CurveEQ... это если подгонка спектра а-ля фириум.
Если надо просто спектры сравнивать, то Roger Nichols Inspector XL (Spectrum Analyzer) - можно три спектра хранить в памяти. Есть другие варианты, например Voxengo GlissEQ позволяет сравнивать спектры разных дорожек в риалтайме.