wwwdimon, У PCI есть разные механизмы для уменьшения загрузки процессора при передаче.
С АЦП идут цифровые данные, но они же не сплошным потоком идут на процессор сами по себе

Задержки у USB всегда выше, даже если пропускная способность не используется на всю.
Замерь какое-нибудь внешнее решение в лупбеке и внутреннее и посмотри задержку.
Раньше с PCI полная задержка состояла из двойного размера буфера + задержки АЦП и ЦАП и фактически всё.
Потом PCI стали делать через мост PCI-PCI-E, тут ещё немного добавилось.
А у USB добавка к базовым задержкам намного существеннее.
Зачастую при той же общей задержке у внутренних карт (PCI/PCI-E) размер буфера можно выставлять в пару раз больше, что положительно сказывается на стабильности работы, т.к. "процессору" даётся шанс равномернее распределить загрузку по времени (помимо аудио есть же ещё куча других тредов в системе).