Тут надо комплексно подходить к вопросу, скорее всего что-то просто не так настраивается.
Проблемы:
1. Слишком большой гейн карты и клиппинг входа (надо может быть включить пад)
2. Много гейна у ампсима
3. Неудачный выбор импульсов
4. Уровень на выходе выше цифрового нуля (клиппинг на выходе).
Или речь типа о шуме? Гитары неплохо ловят наводки от телевизоров кинескопных, могут быть и другие помехи. Может помочь ориентация в пространстве.
Нужен пример диайника (сигнала напрямую с гитары, то что на входе в ампсим) и конечный результат, чтобы диагностика могла состояться 
1. Гейн я регулирую чтобы не переваливало за индикаторы на красное
2 На ампсие тоже стоят внизу уровни входного сигнала и мастера. Там соответственно тоже ставлю чтоюы все было в пределах
3. Какие импульсы? Если я втыкаю гитару в Амплитьюб, то разве что-то еще должно быть кроме чистого звука гитары который программа обрабатывает
4 Может быть конечно, но как определить,
Сигналы сделаю
Такое возникает только на сильном перегрузе,
Настройки просто беру из библиотеки.
В Амплитьюб есть закладка Browse и там перечень различных готовых настроек
Santjago
Очень может быть. Так как я понятия не имею что это и как их использовать, а также для чего они
... и добавил: