1. Встроенная это плохо, купи какой нибудь Аудиджи 2 хотя бы. Это избавит тебя от кучи лишнего шума и помех!
2. Напрямую втыкать нельзя, минимум через какую нибудь примочку (Overdrive какой нить), лучше если это будет преамп типа Art Tube MP.
3. Ампсим это твои программы TH1 и Гитар Риг.
4. Да, звук на самой гитаре, мне часто это помогает уменьшить шумы, так как бридж у меня очень мощный и приходится немного подбирать звук.
5. У меня тоже так было что клин подмешивался, это тебе надо в микшере где то убрать чтоб клин не воспроизводился, точно не помню уже как. может еще кто то тебе подскажет, но эта проблема решаема и она у всех почти когда то была.
И кстати, еще я заметил что если с гитарой отойти от компа подальше то фон тоже становится меньше, и убедись еще что у тебя гитара экранирована.