Postie, в общем случае зависит от гаммы. в гармонайзерах есть возможность задать заранее, тогда педалька тебе сама гармонию подберет.
но тут надо помнить, что гармонизация квинтой, квартой, октавой или унисоном (и им гармонизируют), всегда будет однозначной, независимо от ступени гаммы.
если терция, секунда и пр. - то либо большая, либо малая.
в первом случае просто транспонируй на 5/7/12 полутонов партию и не заморачивайся, во втором - читай теорию, про ступени гаммы. в книге троя стетины (troy stetina) speed and thrash metal есть очень кратко как делается гармонизация, можешь там почитать. или в гугле.