Если хочется увидеть искажения, то гонять синусы разных частот, свипы по частоте и уровню, сразу будет видно гармоники. Чтобы проверить байпас педали то подавать синус разного уровня, смотреть с какого уровня начнут расти гармоники (ну и вообще как себя ведут), смотреть на форму волны, если байпас на транзисторе, то обычно нижняя полуволна начинает обрезаться раньше, ещё до потолка по питанию. Чтобы понять как влияет на частотку, определить с какого уровня искажения и прогнать синусидальный свип с уровнем чуть меньше, потом посмотреть как частотка меняется, но тут надо математическими пакетами пользоваться, чтобы определить разницу, так сказать провести деконволюцию.