По входу правильно написали, надо через педаль с регулировкой уровня подключить и уровень попробовать уменьшить. В любой программе гитарной (Амплитуб, ГитарРиг и т д) есть ручки входного уровня и выходного уровня. И индикаторы этого самого уровня. Надо посмотреть не эти самые индикаторы повнимательнее. И также интересно уточнить, как в стерео вход (который линейный) воткнута гитара, которая моно? В один канал или как еще?
P.S. И Виндовс какой?