Читай мануал, во-первых.
Options/Audio- всё настроил? Driver mode нужно выбрать или ASIO, или WDM, но не ММЕ. Потом выставить задержку, хотя бы 10мс. Создаёшь в проекте аудиотрек, в свойствах трека выбираешь вход звуковой карты, к которому гитару подключил и аудио выход. Жмёшь кнопку input echo (справа от R), дёргаешь струну- индикатор должен показать, что сигнал на входе есть. Вставляешь в FX bin Amplitube, выбираешь пресет в нём и по идее всё должно заработать.