Во-первых, нужно посмотреть виртуальный микшер аудиодрайвера (кто-то уже упоминал об этом). Возможно, мониторится прямой сигнал в обход хоста.
Во-вторых, такое случается, когда сигнал инструмента приходит на ампсим, стоящий в режиме "стерео", при этом входной сигнал панорамирован, например,
как 99L-1R, ну или там 3L-97R. Артефакты с этих самых 1R или 3L недогружают усилок, звуча почти как clean-сигнал.