Первый возникающий вопрос - какая звуковая карта, вход инструментальный в ней есть?
Смысла в педалях перед Амплитюбом вообще не вижу. Любой перегруз можно в плагинах нарулить, но ИМХО Амплитюб не самый лучший плагин для гитары, тот же самый JCM 800 в нем звучит с явным перебором нижней середины, а ректифаер вообще непойми на что похож.
Ну и с входным уровнем можно в самом амплитюбе поиграть, когда уровень низковатый, то верха будут срезаться.