Погонял. Ваш импульс видимо снят не совсем точно.
Вот мой импульс (получил из Ваших файлов) и результат с его применением вычитания с Reamp_PA_load_matched.wav
Вот этот difference2 уже того ухающего низа нету(дыхания), все что осталось - и есть тот окрас усилителя, те нелинейные искажения, которые всегда в гитарных присутствуют даже на малой громкости. Низа немного осталось по скольку нелинейные искажения усилителя зависят от импеданса нагрузки тоже..
Если в реальности повозится и снять точный импульс с системы, то отличий станет еще меньше..
А если использовать качественнй усилитель с ООС, но с таким же выходным импедансом, как гитарный(достигается применением ООС по току), то отличий не будет вовсе( мож зуда немножко из за расхождений)...
Вот еще немножко фазу покрутил - difference3
На громкость не обращайте внимания, она там увеличена
Карта у меня 44.1 не воспроизводит, поэтому я ресэмплил все это дело из за чего тоже отличия уввличиваются...