Juron,
Создаешь аудио трэк, вешаешь Амплитуб на него, нажимаешь кнопочку мониторинга с маленьким динамиком, записываешь. На самом деле пишется в трэк чистый звук, который можно обработать потом чем угодно. Можно при сведении сразу крутить настройки Амплитуба, который висит на трэке и подправлять звучание на ходу, а можно сделать миксдаун этого трэка в новый аудиотрэк и тогда будет уже трэк, обработанный Амплитубом.