Скорее всего всё в порядке, предположения верны: толстые струны должны быть чуть выше над грифом, чем тонкие. На фиксированном бридже это решается либо индивидуальной регулировкой струн, либо регулируется целиком наклон бриджа. Вести гриф от этого не должно.