Вообще допускается.. главное! что бы звучали только нужные струны, что ты делаешь с остальными не важно
Каждый аккорд имеет несколько аппликатур и музыкант выбирает удобную для себя и для композиции. Существует баре, мини баре...
Тебе нужно просто больше выучить аккордов и научиться их свободно играть и переставлять (я так понимаю сейчас речь идет именно об игре аккордами). Одним словом практика, практика, практика
ЗЫ кроме боя есть еще перебор, щипок и прочее и их комбинации
ЗЫЫ второй пример и вопрос как быть не ясен так как опять нужна конкретная ситуация, где не получается заглушить струны. Вообще больше практики - пальцы станут более гибкими... проверь постановку левой руки (видео много есть), сходи хотя бы на 1-2 занятия к педагогу, смотри больше видео для начинающих (много где с простых аккордов все показывают и рассказывают)