Сделать гармонизацию мелодию для четырех голосов (не для гитары) 
А в чем разница? Кто говорил про гитару?
Я говорил о том, что либо надо делать на акколаде скрипичный+басовы, чтобы все было видно и, главное, без транспонирующих ключей, иначе бред. А если нет акколады, то на одном гитарном нотоносце без учета аппликатуры (то есть речь не о гитарной транскрипции) - пожалуйста, все 4 голоса та поместятся, только сопрано надо писать на октаву выше (то есть в правильном по музыке регистре). Если не хватает низа, можно 7ю струну добавить, тогда весь "рабочий" диапазон фо-но для гармонизаций точно вместится.
Мне кажется, ответственность за то, чтобы голоса не были перепутаны, несет автор гармонизации.
Нет, вы не правы. Ответственность несет тот, кто выкладывает мелодию в неверном регистре. При этом не указывая точно источник.
Если вы выкладываете задания из учебника, то надо записывать их в той же октаве, что и в учебнике, то есть в ГП это на октаву выше. Для одной мелодии это может быть не очень критично, но когда подставляются аккорды еще ниже, становится... нехорошо.
Возможно, я сильно ошибаюсь, но мне кажется, что использование GP не влияет на результат гармонизации
Ох, еще как влияет, если пользоваться только им (как здесь многие и поступают). Или если потом прослушивать, тупо переместив то, что на бумаге было написано, так как звучать все будет на октаву ниже.
Лично я, например, две первых мелодии гармонизировал на листке бумаги, а уже после "забил" в GP.
Или я чего-то не понимаю? 
Видимо - да.