При "параллельной" перестройке гитары (соотношение струн сохраняется стандартное) ноты на грифе мыслятся, как обычно - не переучиваться же тем, кто знает ноты на грифе в стандартном строе.
Если у вас нет камертона, Вы можете настроить гитару произвольно - выше или ниже, но относительные ноты у вас останутся на грифе там же, верно? Если вы, конечно, знаете ноты на грифе.
Поэтому 6-я открытая струна попрежнему считается Ми, хотя реально звучит Ре и тд. Это так, называемый, транспонирующий инструмент, такой же как труба, сакс, тромбон. Так что ноты написаны правильно.