Не вижу тут никакой проблемы.
Харпер, например, выучил ноты в строе Рихтера, на до-мажорной гармошке, если берет, например, ля-мажорную, то он не мыслит нотами ля-мажора, а представляет как будто играет на до-мажорной.
С гитарой тоже самое, спусти строй ниже, но играешь как будто в стандартном Ми.
А прикиньте еще транспонирующие инструменты, практически все духовые, вот играет саксофонист в до-мажоре, а на самом деле у него си-бемоль, та это просто нужно иметь ввиду, так если думать голова кругом пойдёт, так никто не делает.