Бумага и краска - не вариант. Просто сотрется под пальцами... (а краска залитая в дырки - это, просто, жуть
)
Если уж так нужны точки на грифе - нужно делать инкрустацию. Если гитара не очень дорогая, и руки из нужно места, то простую инкрустацию "точками" - можно сделать и самому.
Понадобится дрель с "фрезерным" сверлом. Пробойник или трубка с острым краем нужного диаметра (Для изготовления "точек"). Лист пластика, и клей. (по хорошему, еще и деревянные тиски... Но, в принципе, можно обойтись и без них...)
PS: Что либо кроме кругов - в домашних условиях ты, врядли, сделаешь... (если не гений, конечно... И под рукой нет фрезера.)