В общем я придерживаюсь такой последовательности очистки всякой бяки:
1. автозагрузка программ
2. отключение ненужных процессов
3. настройка антивируса на сканирование "на лету" только exe, bat, rar, jar, zip, dll, vxd, msi. Без эвристического анализа.
4. в топку все темы винды. Если можно сделать "драную" тему 98й винды - то её, если нельзя то просто выкл все эффекты.
5. настройка браузера (тут уж очень зависит от того какой он, браузер)