Кто знает как там pad реализовали. Так что лучше всё-таки его отключи. Тем более что говоришь что с включением звук хуже становится. Часто там подрубается низкоомное сопротивление, тупо понижается входное сопротивление
В картах обычно пад не меняет импеданс, в отличие от директбоксов.
А звук "хуже" может быть тупо связан с уровнем сигнала, уровень меньше - перегруза меньше
Но, безусловно, надо смотреть, записать и так, и так, с одним уровнем и посмотреть на АЧХ (или нормализировать оба для точного сравнения).