Трудно так ответить сразу, возможно большой пик-фактор у гитары, т.е. разница между тихими звуками и громкими, тогда да, будет казаться что гитара звучит тише, в таком случае нужен компрессор\лимитер, для снижения пик-фактора.
... и добавил:
Опять же, гитара тихая по входу или когда же пропущена через плагин?