Я вот не могу понять одной вещи.
Кварта в мажоре и миноре одинаковая - её назвали чистой.
Квинта в мажоре и миноре одинаковая - её тоже назвали чистой.
Секунда в мажоре и миноре одинаковая тоже, но почему сделали большую и малую? Выходит только ради хроматической гаммы стоило вносить понятие Малая секунда?
Что-то Вы не то говорите, простите. Интервалы бывают диатонические и хроматические.
Диатонический интервал, имеющий одну разновидность, называют чистым (прима, кварта, квинта, октава), две разновидности - большим или малым (секунда, терция, секста, септима).
В Вашем случае, секунда - это как раз диатонический интервал, имеющий две разновидности.
Почитайте вот этот материал. Надеюсь, он Вам поможет разобраться!
http://www.7not.ru/theory/05.phtml