Все просто.
1. Берем 2 разные гитары, фиговинькую и хорошую. Ставим одинаковые новые струны, настраиваем в стандартный строй. Получаем _очень_ разный звук, который любой отличит.
2. Берем 2 одинаковые гитары, ставим разные струны. Например, бронзу и фосфорную бронзу. Калибр пусть будет одинаковый. И опять получаем разный звук, который слышно невооруженным ухом.
Во всех 4-х случаях набор базовых частот одинаковый, ибо строй одинаковый и ноты одни и те же. Но звук будет разный. И вот эту разность и дают те самые гармоники-обертона, значимость которых некоторые тут пытаются принизить.